字琴航,王鹏之子。
肇谦在道光二十六年(1846年)中举,后选授福建海城令,为人廉洁自谨,侍奉父母常象孩子那样承欢,交给他的任务象不能胜任的样子。到做官后办起事来就果敢有为。遇到事情难以推动,常据理力争,即使在大官面前也不示弱退让。因此在海城一带的山海间颇有名望,善于处理狱讼案件,尤善于捕贼,在上抗任职期间,嘉应州匪徒窜入邑境,他亲率兵士追捕,直攻入其巢穴,擒贼17人而归。后王肇谦调漳州,海城一带的士民痛哭挽留,拉着他的车辕不让走,而且联名上书请求。书中说:他是大仁之人,不可失也。并说,如果天下各县之主,都象我县之主,何患天下不太平。
先前,王肇谦曾因接受渔山县盗匪陈双喜一案,奉旨同知直隶州,后又补为永春州州牧。此地有土匪邱狮扒辜横行于乡间,到任8天即擒获他们。又调去署管漳州府。他在漳州从政3年,使这里百废俱兴,人们称他漳南一支柱,而且说他有于清端公治理黄州那样的遗风。
肇谦考虑到父母年老,曾多次请示归省,却未能被批准归乡,后改任延建郡道,咸丰七年(1857年)8月卒,时年51岁。